1958年,创建北京市农业学校;
1984年,成立北京市农业管理干部学院;
2001年6月,北京市农业学校和北京市农业管理干部学院合并组建北京农业职业学院;
2002年4月,北京农业职业学院正式挂牌;
2003年5月,合并原北京市城乡建设学校;
2004年12月整建制合并原北京市城乡建设学校及原北京市八一农业机械化学校,成立北苑分院、清河分院,形成“一院四区”办学格局。
2005年10月,学院被中央精神文明建设指导委员会评为“全国文明单位”。
2006年3月,被市教委等部门联合授予“北京市职业教育先进单位”荣誉称号。