2018年国地税合并，我在县级国税局，我舅在同一个县的地税局，合并后我俩就在一个单位了。

理解有误。不是不能在一个单位工作，而是不能有直接的领导和被领导关系，或者一方是领导，另一方不能从事组织、人事、纪检、监察、审计和财务工作。
规定如下：
公务员之间有夫妻关系、直系血亲关系、三代以内旁系血亲关系以及近姻亲关系的，不得在同一机关担任双方直接隶属于同一领导人员的职务或者有直接上下级领导关系的职务，也不得在其中一方担任领导职务的机关从事组织、人事、纪检、监察、审计和财务工作。
公务员担任乡级机关、县级机关及其有关部门主要领导职务的，应当实行地域回避，法律另有规定的除外。