收购农产品在税法上讲是要进行计算抵扣进项税额的，具体做法：
用发票上注明的货物金额乘以13%作为进项税额抵扣，然后用发票上的金额减去抵扣的进项税额作为货物的成本进行入账，具体会计处理：
借：原材料等 发票注明金额x（1-13%）
应交税费-应交增值税（进项税额） 发票注明金额x13%
贷：银行存款 发票注明金额
企业购进农产品，属于以下几种情况进项税额可抵扣：
1、取得一般纳税人开具的增值税发票或海关进口增值税专用缴款书，以票面增值税额为进项税额。
2、取得小规模纳税人开具的增值税专用发票，以增值税专用发票上注明的不含税金额乘以10%为进项税额。
3、取得自开或代开农产品收购发票，以农产品收购发票上注明的金额乘以10%为进项税额。
4、取得自产农产品销售发票，以农产品发票上注明的金额乘以10%为进项税额。
5、纳税人购进用于生产销售或委托加工16%税率货物的农产品，以取得发票上注明的金额乘以12%为进项税额。
扩展资料
《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号《营业税改征增值税试点实施办法》第二十五条第（三）项规定，购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。
计算公式为：进项税额=买价×扣除率。买价，是指纳税人购进农产品在农产品收购发票或者销售发票上注明的价款和按照规定缴纳的烟叶税。购进农产品，按照《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》抵扣进项税额的除外。
