0.5-1倍体积的异丙醇可以选择性的沉淀DNA和大分子rRNA和mRNA，但是对5SRNA，tRNA以及多糖等不产生沉淀。一般不需要等温放置很长时间，其缺点是易使盐类DNA共沉淀，而且异丙醇难以挥发除去。必须用70%乙醇洗涤。
无水乙醇沉淀DNA需要阳离子如Na离子的存在，而且需要1/1O体积的NAAC，并且加2倍体积的无水乙醇，而且沉淀的盐少，易挥发除去。缺点是总体积较大。需在-20放置很长时间，30分钟-1小时。同样需要70%乙醇洗涤。
我个人认为无水乙醇沉淀DNA的效果更好些，DNA在体积较大的条件下可以沉淀的更充分，提取的DNA含的盐离子也很好，而且乙醇也容易挥发去除，纯度相对来说也较好。
两者都适合沉淀线形和闭环的DNA或质粒，因为两者化学性质都是醇类，沉淀原理是相似。
如果你的DNA含量丰富的话，沉淀10min 就足够了，如果含量低，则需要在-20度沉淀30min-2小时。可以不短观察沉淀的量决定沉淀时间。
