从病原学角度说：TH1细胞偏向于抗胞内病原体感染，TH2细胞偏向于抗胞外病原体感染。因此，从免疫学角度来讲，可以看作为TH1倾向细胞免疫为主，TH2倾向于体液免疫。
根据细胞因子分泌模式，CD4+T细胞可分为Th1和Th2亚群，Th1主要分泌IL-2，IFN-γ,TNF-α和TNF-β称为Th1型细胞因子；Th2主要分泌IL-4，Il-5,IL-6，IL-10和IL-13,称为Th2型细胞因子。
Th1介导细胞免疫、细胞毒性T细胞(CTL)和巨噬细胞活化以及迟发型超敏反应(DTH)；Th2介导体液免疫、B细胞和嗜酸性粒细胞活化以及IgE的生成。
很多自免疾病中存在细胞因子不平衡的情况：比如类风湿关节炎、莱姆病、多发性硬化症、胰岛素依赖型糖尿病和慢性甲状腺炎中，Th1及其细胞因子占优势，这些疾病可被归为Th1状态；但是在过敏性疾病、哮喘、硬皮病、系统性红斑狼疮以及HIV感染中，Th2及其细胞因子占优势，处于Th2状态。
总的来说：Th1型细胞因子主要为炎症性细胞因子，而Th2型细胞因子则有抗炎效应。
从疾病进程来看：在器官特异性自身免疫病中，Th1可诱导发病，加速疾病进程；Th2能阻止发病，缓解病情。
现在免疫学上研究较为热门的是DC，DC1分泌大量IL-12，在促进抗胞内病原体感染的THI细胞发育中有重要作用；DC2可TH2细胞分泌细胞因子，在抗胞外病原体感染中有重要作用。从这点上说，临床自免疾病可以结合DC来做一些文章。
