没有区别。
税率和注册资金没有关系，只和注册资本印花税有关系。
100万的印花税是500元，500万的印花税是2500元，只在注册的时候征收。以后经营，所有税率征收和注册资金没有任何关系，只和具体的业务和财务数据有关系。
比如餐饮、美容美发行业这种税率是5%营业税；销售及服务类的就是3%的普通增值税。一般纳税人的则是17%。
拓展资料：
“注册资金”指集体所有制（股份合作）企业的股东实际缴付的出资数额；全民所有制、集体所有制企业法人经营管理的财产或者全部财产的货币表现，是国家授予企业法人经营管理的财产或者自有财产的数额体现。
注册资金就是企业全部财产的货币表现，是企业从事生产经营活动的物质基础，是登记主管机关核定经营范围和方式的主要依据。
参考资料：注册资金_百度百科
