龙眼树的花芽生理分化一般出现在12月至翌年1月，此时要求枝叶等营养器官停止生长以促进物质的积累，一般相对干旱和适当低温较有利于花芽生理分化。龙眼花穗一般在2月上旬至3月下旬抽生，此后开始形态发育逐渐形成完全花穗。在此期间必须防止“冲梢”。龙眼开花期一般在4月中旬至5月下旬，依地区、品质、气候、树势、抽穗期等而异。单穗花期20天左右，全树花期30天以上，在同一果园内，同一母树雌花、雄花常交错并存，授粉机会较多。龙眼开花期间营养消耗很大，据测试，花器含氮7.4～13.72克/千克、磷1.69～4.82克/千克、钾17.38～26.52克/千克。
