主词条：DKZ47型地铁电动客车
6号线采用长春轨道客车股份有限公司研制的DKZ47型列车（64组，车号：06 001-06 064） ，该车属于8节B型车（“六动两拖”，6M+2T） ，采用不锈钢车体。与2010年制造的DKZ31,32,33（分别用于15号线，亦庄线，9号线）相比，该车使用1500伏特接触网供电，可以保障列车的供电性能，与DKZ33不同，6号线列车并未有安装“黑匣子”，但却拥有1时15分的超长时间供电。列车与DKZ33唯一的相同点是可以从刹车摩擦与缓冲摩擦吸取电能。列车最高运行时速100千米/小时，旅行时速为50~60千米/小时。列车全列定员1976人，比普通6辆编组列车多承载400人 。列车外观黑色底色，腰部涂有黄线，车头黄色和黑色搭配，被市民昵称为“大黄蜂” 。 换乘站
截至2015年12月26日，6号线拥有换乘车站9座。与同期建设的新线换乘的车站有慈寿寺站和白石桥南站，两座车站均是共用站厅，并通过站台之间的楼梯相连 ；此外，南锣鼓巷站与8号线换乘，出于文物保护需求，两座车站均是叠落式车站，中间通过通道相连，实现同站台换乘 。与既有线路的换乘站有2号线的车公庄站、朝阳门站，4号线的平安里站，5号线的东四站，10号线的呼家楼站等，这几座车站均是通过通道连接 ，其中呼家楼站设置了多达8条换乘通道以防止客流冲击 。这些车站的换乘通道最长不超过120米。
室内设计
6号线在运河商务区核心区的三站（通州北关、通运门、北运河西）使用了中庭式设计，首次在北京地铁车站中引入了中庭的空间形式。其中，通运门站为实现快慢车运行模式而采用了双岛式站台，因而成为了国内首个轨行区敞开的中庭式车站；而北运河西站直接设置在商业地块内，利用上方步行广场和绿地设置了天窗，为北京地铁首个设置天窗的车站。与国内其他设置中庭式车站的城市相比，北京的消防设计标准较高，为此这三座车站专门进行了消防性能化设计。
6号线一期的室内设计理念为“京城连廊”，突出线路串联内城、CBD、金融街、东部居住区等大量城市区域的特色。各个车站均以不同颜色的砖进行装饰，同时又有各自的特色。
一期线路的西段（海淀五路居至车公庄西）多为20世纪50年代至80年代建设的红砖建筑，因此车站内部也采用红色的砖饰面；中段（车公庄至朝阳门）穿过老北京城，地上建筑多为灰砖房屋，因而车站内部也采用灰色的砖饰面；东段（东大桥至草房）是1990年代后快速发展起来的新兴都市区，采用彩色的砖饰面。
6号线一期设置了多个装修重点站，其装修风格又各自不同。车公庄西站由于临近1950年代建设的苏联式建筑——北京展览馆，车站内部采用大量拱顶设计，模仿莫斯科地铁的车站风格；北海北站临近皇家园林，因而采用绿琉璃色的重檐飞椽，体现皇家园林的气派；南锣鼓巷站临近四合院区，因而也仿照四合院的建筑风格进行装饰；东四站采用接近原木颜色的梁柱装饰，暗示牌楼；朝阳门站结合车站结构，在站厅内布置倒“U”型的“门”，包含朝阳门历史上曾是漕运粮食进京的城门的寓意 。
6号线二期由于贯穿通州北运河两岸，故在三座中庭式车站外，其余的四座车站以大运河为主题，选用了四种不同的颜色作为主题，代表大运河所经过的四大流域。 6号线拥有车辆基地3座：五路停车场、五里桥车辆段和东小营车辆段。
五路停车场位于慈寿寺站西北方向，与10号线共用，6号线列车停放在停车场地下一层，随6号线一期建成 ；
五里桥车辆段位于草房站和物资学院路站之间，随6号线一期建成 ；
东小营车辆段位于潞城站东南，为6号线二期工程的一部分 。但由于拆迁问题，工程进展缓慢。未能随6号线二期投入使用。
