执业药师队伍存在“不够用，不好用，不真用”问题。门槛低、待遇低、社会地位低使得大量执业药师不愿去零售药店工作。
执业药师证“空挂”，证在店堂、人不在岗问题是困扰药品市场监管人员多年的顽疾。在各地各类媒体记者对药店的暗访中，违规销售处方药、执业药师不在岗是“中招率”最高的两个软肋。面对国家的强制规定，一些零售药店开始打“擦边球”，或租赁证照，或将药店“过户”到执业药师名下，只用证件不用人。
尽管学历不是衡量人才的唯一标准，但是我国执业药师的低学历和报考的低门槛不得不让人忧虑。“学医的，学药的，学生物、学化学的都可以报考执业药师。已注册的执业药师大专及以下学历者高达61.9%。药店老板宁愿雇佣工资较低的中专生。如果不有效解决不真用的问题，则本科以上学历者上岗率不易提升，最终难免出现劣币逐良币现象。”
