在市区某机关担任副主任科员等于乡镇县什么级别的？

无论在哪里，副主任科员都是副科级

国家根据公务员职位类别设置公务员职务级别(序列)，中国公务员的行政级别按《中华人民共和国公务员法》（2005年4月27日第十届全国人民代表大会常务委员会第十五次会议通过）规定分为国家级正职、国家级副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职，非领导职务层次在厅局级以下设置。

巡视员： 正厅级
副巡视员： 副厅级
调研员： 正处级
副调研员： 副处级
主任科员： 正科级
副主任科员： 副科级
科员： 正股级