区别如下：
1、办理机构不同，营业执照办理机构为工商所，医疗机构执业许可证办理机构为卫生部门。
2、提供资料不同，营业执照办理提供法人身份证，营业场所证明，照片，而医疗机构执业许可证办理还需提供相应的医疗方面的资料和资质。
3、针对行业不同，营业执照办理人群为各个行业，而医疗机构执业许可证办理人群只针对医疗行业。
扩展资料
营业执照办理流程
1、核准名称，1-3个工作日，确定公司类型、名字、注册资本、股东及出资比例后，可以去工商局现场或线上提交核名申请，核名通过，失败则需重新核名。
2、提交资料，5-15个工作日，核名通过后，确认地址信息、高管信息、经营范围，在线提交预申请。在线预审通过之后，按照预约时间去工商局递交申请材料，收到准予设立登记通知书。
3、领取执照，预约当天，携带准予设立登记通知书、办理人身份证原件，到工商局领取营业执照正、副本。
医疗机构执业许可证办理条件
依据《医疗机构管理条例》的规定，申请医疗机构执业登记、取得《医疗机构执业许可证》应具备六项条件：
1、有设置医疗机构批准书；
2、符合医疗机构的基本标准；
3、有适合的名称、组织机构和场所；
4、有与其开展的业务相适应的经费、设施、设备和专业卫生技术人员；
5、有相应的规章制度；
6、能够独立承担民事责任。
参考资料：百度百科—营业执照
