不算首套房，会影响公积金贷款买房。
根据二套房认定标准：
婚前一方曾贷款购房，婚后以另一方名义申请贷款购房，但两人户口没有在一起。
但是由于夫妻双方结婚后虽然户口没有落在一起，但在民政局有过结婚登记。现在，银行在批贷时除要求借款人提供户口本外，还会要求借款人提供婚姻状况证明，而结了婚的夫妻是不能提供单身证明的，所以另一方再购房时也会被算作第二套房。
因此还是会算作第二套房。
配偶一方申请了住房公积金贷款，在其未还清贷款本息之前，配偶双方均不能再获得住房公积金贷款。因为，住房公积金贷款是满足职工家庭住房基本需求时提供的金融支持，是一种"住房保障型"的金融支持。
因此配偶还在还贷，会影响公积金贷款买房。
扩展资料
银行认定为二套房的七种情况
1、父母名下有住房，以未成年子女名义再购房。
2、未成年时名下有房产，成年后再贷款购房。
3、个人名下有全款购买的住房，再贷款购房。
4、个人名下有贷款购买住房，结清出售后再贷款购房。
5、首次购房使用商业贷款，再次购房使用公积金贷款。
6、婚前一方曾贷款购房，婚后以另一方名义申请贷款购房，但两人户口没有在一起。
7、婚后双方共同贷款购房，离异后一方再申请贷款购房。
参考资料
