“欠缴增值税、又有留抵税额处理”是能同时存在的。
比如企业一月份应交增值税100万元，但一直拖欠着不交，二月份的进项税大于销项税，产生了留抵税额，此时就可以按规定用2月份的留抵税额，抵减1月份的欠税。需要注意的是，1月份的欠税还是应交滞纳金的。
为了解决增值税一般纳税人既欠缴增值税，又有增值税留抵的问题，国家税务总局《关于增值税一般纳税人用进项留抵税额抵减增值税欠税问题的通知》(国税发[2004]112号)规定，对纳税人因销项税额小于进项税额而产生期末留抵税额的，应以期末留抵税额抵减增值税欠税。
纳税人发生用进项留抵税额抵减增值税欠税时，按以下方法进行会计处理：
(一)增值税欠税税额大于期末留抵税额，按期末留抵税额红字借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目，贷记“应交税金——未交增值税”科目。
(二)若增值税欠税税额小于期末留抵税额，按增值税欠税税额红字借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目，贷记“应交税金——未交增值税”科目。
为了满足纳税人用留抵税额抵减增值税欠税的需要‚国税发[2004]112号文件将《增值税一般纳税人纳税申报办法》(国税发[2003]53号)《增值税纳税申报表》(主表)相关栏次的填报口径作如下调整：
(一)第13项“上期留抵税额”栏数据，为纳税人前一申报期的“期末留抵税额”减去抵减欠税额后的余额数，该数据应与“应交税金——应交增值税”明细科目借方月初余额一致。
(二)第25项“期初未缴税额(多缴为负数)”栏数据‚为纳税人前一申报期的“期末未缴税额(多缴为负数)”减去抵减欠税额后的余额数。
此外，关于抵减金额的确定，国家税务总局《关于增值税进项留抵税额抵减增值税欠税有关处理事项的通知》(国税函[2004]1197号)规定，抵减欠缴税款时，应按欠税发生时间逐笔抵扣，先发生的先抵。抵缴的欠税包含呆账税金及欠税滞纳金。确定实际抵减金额时，按填开《增值税进项留抵税额抵减增值税欠税通知书》的日期作为截止期，计算欠缴税款的应缴未缴滞纳金金额‚应缴未缴滞纳金余额加欠税余额为欠缴总额。若欠缴总额大于期末留抵税额，实际抵减金额应等于期末留抵税额，并按配比方法计算抵减的欠税和滞纳金；若欠缴总额小于期末留抵税额，实际抵减金额应等于欠缴总额。
