中国国际交流协会最高权力机构为理事会。理事有来自中国共产党、民主党派、人民团体、学术界、经济界、企业界、宗教界、文艺界、新闻界、外交界、教育界等各方面的人士、专家和学者。
中国国际交流协会首届会长是著名社会活动家、外交家、文学家和书法家李一氓先生。其后有中国著名社会活动家，曾任全国人大常委会副委员长、中国民主促进会主席的雷洁琼女士、曾任中国人民政治协商会议副主席、中国政府副总理兼外交部长的吴学谦先生、以及曾任中国人民政治协商会议副主席的李贵鲜先生。现任会长是全国人大常委会副委员长、民革中央主席周铁农。
中国国际交流协会的日常工作由秘书长负责。2003年5月起，中国国际交流协会享有联合国经社理事会特别咨商地位。
交流协会出版英文会刊《国际交流》（季刊）。
