一、参保范围不同
城镇职工医疗保险的参保范围是城镇用人单位及其职工和参加了基本养老保险的灵活就业人员；
城镇居民医疗保险的参保范围是不属于城镇职工基本医疗保险制度覆盖范围的所有城镇居民。
二、缴费标准不同
城镇职工基本医疗保险费由用人单位和职工共同缴纳。在职职工按本人工资总额的2%缴纳，用人单位按在职职工工资总额的7.5%缴纳。退休人员本人不缴费，原用人单位按退休人员退休（养老）金总额的5%缴纳。灵活就业人员由本人按上年度全市在岗职工平均工资的8%缴纳。
城镇居民基本医疗保险费由个人缴费和政府补助构成，筹资水平根据全市上年度城镇居民人均可支配收入的一定比例确定。其中：在校学生和未满18周岁非在校少年儿童每人每年的筹资水平为全市上年度城镇居民人均可支配收入的1%左右；其他非从业城镇居民的筹资水平为全市上年度城镇居民人均可支配收入的2%左右。
三、缴费年限不同
城镇职工医保退休后个人不在缴费，但灵活就业人员的最低缴费年限为15年，退休时不够15年的要一次性补够15年，才能享受退休职工医疗待遇。
城镇居民医保终生缴费，才能终生享受。
四、医疗待遇不同
（一）最高支付限额。
按今年的标准，统筹年度内的基本医疗保险最高支付限额分别为城镇职工7万元、城镇居民3万元。
（二）起付线及报销比例。
（三）个人帐户。
城镇职工医疗保险实行统筹和个人帐户结合的模式，要建个人帐户（目前灵活就业人员在职约为50元/月，退休约为53元/月）。
城镇居民医疗保险全部实行统筹，不建个人帐户。
