发证机关不同
大红本是城市国有土地上建设的房屋、房地管理部门颁发的房屋产权证，是国家发的正式的房产证,因其外观为16开红色得名。
小红本是区县政府发给集体土地上建设房屋的房屋所有人的产权证。
产权权重不同
“大红本”是正规的房产证，颜色大红色，标有“中华人民共和国”字样，产权证附记档页下方加盖房屋所在地的房地产产权监理处公章，表明购房者所购得的房屋在开发建设时有合法的土地审批手续，有合理的国家规划部门批准通过的规划许可证。
“小红本”比正规的房产证小，颜色为暗红色的，不是国家统一颁发的，许多是城中村改造项目，没有百分之百的产权，只有集体单位发的居住证。
扩展资料：
按照我国法律的规定，我国对房屋等大宗财产的管理，是采用行政登记的手段，即行政机关或其委托的机构(如房监所)通过一定的程序审查、登记，最后向房屋所有权人颁发房屋产权证书。
房屋所有权证书上载明的权利人行使占有、使用、收益、处分的权利。
我国的房地产市场通过这样的权属管理模式，较好地杜绝了一房多主、一房多卖的问题，最大限度地防范了房地产市场的交易风险。
房屋的产权从概念上讲是没有大小之分的。
依据建设部城市房屋权属登记管理办法的规定，县级以上地方人民政府由一个部门统一负责房产管理和土地管理工作的，可以制作、颁发统一的房地产权证书。
依照《城市房地产管理法》的规定，将房屋的所有权和该房屋占用范围内的土地使用权的确认和变更，分别载入房地产权证书。房地产权证书的式样报国务院建设行政主管部门备案。
参考资料来源：百度百科——产权证
参考资料来源：百度百科——大红本
