第三套人民币的防伪措施主要是水印和图案中隐藏的暗记。具体如下：
壹角券[1960年版]：（空心五角星满版水印）正面推独轮车的人前穿浅色衣服的人裤子上有一颗空心五角星“☆“暗记。
壹角券[背绿水印]：（空心五角星满版水印）正面大门右侧六、七根栏杆之间上有字母“A”暗记，下方有个“一”，“A”的左上方有字母“J”暗记。
壹角券[背绿]：（无水印）正面大门右侧六、七根栏杆之间上有字母“A”暗记，下方有个“＋”，“A”的左上方有字母“J”暗记；副行长章左上方有“人”字暗记（这一条只有部分背绿才有）。
壹角券[背棕凹印]：（空心五角星满版水印或无水印）正面大门右侧六、七根栏杆之间上有字母“A”暗记，下方有个“·”，“A”的左上方有字母“J”暗记。
壹角券[背棕胶印]：（无水印）正面大门右侧六、七根栏杆之间上有字母“A”暗记，下方有个“·”，“A”的左上方有字母“J”暗记；左边第二个人手腕上有“中”字暗记。
贰角券[胶印]：（无水印）大桥左侧桥头右侧坡地上有数字“2”暗记；左上侧原野图案中有“田”字暗记
贰角券[凹印]：（无水印）未发现暗记。
伍角券：（国旗五星水印或无水印）正面右侧小齿轮上有数字“5”暗记；大齿轮下有“中”字暗记。
壹元券：（国旗五星水印或布币/空心五角星混合水印）背面右侧山坡上有“工”字暗记。
贰元券：（国旗五星水印或布币/空心五角星混合水印）背面石油凿井架下的树丛中有数字“2”和字母“R”暗记。
伍元券：（国旗五星水印）背面行长之章右上角有字母“H”、“J”暗记；背面挖掘机窗户上有“天”字暗记。
拾元券：（天安门水印）背面天安门右侧华灯柱子右侧有“工”字暗记；背面天安门左端边缘处有“人”字暗记；背面天安门右侧华灯柱子右上有“工”字暗记。
