美国出于战后冷战政策的需要采取利用日本和天皇的政策，罗斯福总统就明确指出，应巧妙地利用天皇的威信统治日本。在此之后，麦克阿瑟接到美国务院下达的《美国对日政策》只是：“最高统帅应通过包括天皇在内的日本现存的政府机关团体行使其能力……这一政策旨在利用日本现存的政府形式。”麦克阿瑟还接到华盛顿的明确指示：“立即拘捕战犯……但未经下一步协商，不得采取任何有损于天皇的行为。”
麦克阿瑟本人也对天皇的看法起了变化，他以胜利姿态占领日本前，曾认为裕仁天皇应对日本发动的侵略战争负责，但到战后9月27日与天皇会见时，对裕仁表示：“愿对侵略战争负起全责并愿接受任何裁判”的行为很是钦佩，并称赞他是“日本最出色的绅士”，认为“天皇是超过机械化部队20个师团的战斗力量”，他向杜鲁门总统报告：“找不到可以将日皇列入战犯的证据。如果将日皇列入战犯，追究战争责任，必然给日本带来混乱，甚至使日本分裂破碎，爆发出游击战争来；届时美国必须投入百万军队，损失将更为惨重。因此，不能将天皇作为战犯逮捕。”
10月6日麦克阿瑟又接到美国国务院和陆海军组成的协调委员会的秘密指令：“日本国民显然是支持天皇制的。因此指示麦克阿瑟将军在发展立宪君主制和维护天皇制方面要支持日本国民。对天皇制的直接攻击将会削弱民主势力而加强共产主义和军国主义这两个极端势力。故此命令总司令官，望暗中协助扩大天皇的声望，并促使其化神为人。”
在东京审判过程中，必须触及天皇这个“大日本帝国最高统帅”的战争责任问题，一度曾使裕仁的处境岌岌可危，但由于麦克阿瑟对法官和检察官施加了巨大压力，与他们达成了不把日皇牵涉在内的默契，才将裕仁保护过关。对此，麦克阿瑟曾亲自对当时的日本外相重光葵说：“天皇的命是我救的。当时，世界舆论都认为，天皇是日本发动侵略战争的最高统帅，按照国际审判，当然应当处以绞刑。可是，我认为，拯救天皇的生命，让天皇协助（美国）占领军，对于实行占领政策最为有利。”
战后国际局势发展很快，盟国远东委员会于1946年2月26日成立，远东委员会中有许多国家坚决要求废除天皇制，因此，麦克阿瑟亲自提出制定日本信息按法的“三项原则”（一）、改革天皇制；（二）、放弃战争，不保有战力，否认交战权；（三）、废除封建制度，并运用手中掌握的盟军总司令的“绝对权力”，压日本政府接受驻日盟军总部民政局根据他的制定宪法三项原则起草的新宪法草案。
这样。麦克阿瑟迫使日本政府接受了美国起草的新宪法草案，并于1946年4月17日公布了宪法修改草案，又于11月3日吧天皇由绝对君主改为国民的象征，从而使裕仁天皇最终获救。
