各有各的优势，当然也各有弱点。总体来说，浙大的优势更多，更为突出。
如果从学科的覆盖面来说，那么浙大是全国学科覆盖面最广的，南大要差得很远。
从培养模式上说，浙大的培养模式更为先进，并着重对学生的综合能力，提倡学科交叉；南大更注重理论知识和专业素养，因而学风较好，学生专业知识扎实。
从历史文化上，浙大比南大久上那么几年，但更重要的是浙大的求是文化是南大所不能比的。西迁办学更是没有其他任何一个高校可以做到的，这是求是学子最为骄傲的历史。
硬件设施上，那差距就实在是太大了，可以那浙大紫金港和南大浦口对比、浙大玉泉和南大鼓楼对比，两校学生应该都深有体会。
工科、医药、管理、农学等，这些不用比了，南大要比浙大差得远。
文科则是南大要比浙大强的多，虽然浙大有个金庸。
大家都知道南大理科好，其实浙大理科也不弱，尤其是丘成桐带头的数学。南大理科仅次于北大，而浙大仅次于南北二大。
学生的成就、方向不同。浙大有很多校友是各大公司总裁（移动、联通、中石化、颐高等），还有不少著名创业人士（史玉柱等），南大的校友更多的是国内外的教授。
浙江大学，简称浙大，坐落于素有“人间天堂”美誉的历史文化名城杭州。前身是1897年创建的求是书院，是中国人自己最早创办的现代高等学府之一。1928年更名为国立浙江大学。中华民国时期，浙江大学在竺可桢老校长的带领下，成长为中国最顶尖的大学之一，被英国著名学者李约瑟誉为“东方剑桥”，迎来了浙大发展史上最辉煌的时期。
浙江大学直属于中华人民共和国教育部，是中国首批7所“211工程”、首批9所“985工程”重点建设的全国重点大学之一，是C9联盟、世界大学联盟、环太平洋大学联盟的成员，是中国著名顶尖学府之一，教育部“卓越医生教育培养计划”“卓越农林人才教育培养计划”改革试点高校。[1]
截至2014年9月，浙江大学共拥有紫金港、玉泉、西溪、华家池、之江5个校区，占地总面积4.50平方公里，校舍总建筑面积2072303平方米，图书馆藏书643万余册，并有7家附属医院；全日制在校学生45678人，硕士研究生13949人，博士研究生9084人，本科生23633人。[2] 国家重点一级学科14个，国家重点二级学科21个；本科专业123个，一级学科博士学位授权点58个，二级学科博士学位授权点298个，博士后科研流动站52个。
南京大学，简称南大，[1] 是一所源远流长的高等学府。追溯学脉古为源自三国吴永安元年的南京太学，近代校史肇始于1902年筹办的三江师范学堂，历经多次变迁，1949年“国立中央大学”易名“国立南京大学”，翌年径称“南京大学”，沿用至今。
南京大学是教育部与江苏省共建的全国重点大学，国家首批“211工程”、“985工程”高校，首批“珠峰计划”、“111计划”、“2011计划”、“卓越计划”实施高校，也是九校联盟、世界大学联盟、环太平洋大学联盟、21世纪学术联盟的重要成员和东亚研究型大学协会高校。[2-6]
截至2014年12月，南京大学有鼓楼、浦口、仙林三个校区，28个直属院系，各类学生总计31304人。全校设本科专业86个，硕士学位授权一级学科18个，博士学位授权一级学科40个，博士后流动站38个，国家级人才培养基地13个；有一级学科国家重点学科8个，二级学科国家重点学科13个，国家重点（培育）学科6个；有国家实验室（筹）1个，国家重点实验室7个，教育部重点实验室8个，国家工程技术研究中心1个，国家级“2011协同创新中心”2个，教育部人文社会科学重点研究基地4个。[2]
南京大学是哈佛大学白碧德主义影响下的中国“学衡派”的雅集地，被誉为“中国科学社的大本营和科学发展的主要基地”，被杨振宁称赞为“中国最顶尖的大学”。南京大学是国家“985工程”首批九所高水平大学中唯一未合并其他院校的高校，坚持“内涵发展”，保持“原汁原味”办学优势与特色，赢得社会“中国最温和的大学”的美誉
