根据上皮细胞的排列层数和形状，又将被覆上皮分为以下七种：
1、单层扁平上皮：又称单层鳞状上皮，仅由一层扁平细胞组成，从表面看，细胞是不规则形或多边形，细胞边缘呈锯齿状或波浪状互相嵌合，从上皮的垂直切面看，细胞扁薄，胞质少，只有含核的部分略厚。核椭圆形，位于细胞中央。覆盖于心脏、胸腔、腹腔、血管和淋巴管腔面的上皮，称内皮，表面光滑有利于血液和淋巴的流动。覆盖于胸膜腔、腹膜腔和心包腔面的上皮，称间皮，能分泌少量浆液，保持器官间摩擦，有利于血液、淋巴流动以及物质通透。
2、单层立方上皮：由一层形似立方状的上皮细胞组成。从上皮表面观察，细胞呈六角形或多角形；在垂直切面上，细胞呈立方形，核圆、居中。如分布于甲状腺、肾小管的上皮等，具有分泌和吸收功能。
3、单层柱状上皮：由一层形似柱状的上皮细胞组成。从表面观察，细胞呈六角形或多角形；在垂直切面上，细胞呈柱状，核长圆形，常位于细胞近基底部，其长轴与细胞长轴一致。如衬贴于胃肠道、胆囊、子宫腔面的上皮，具有分泌、吸收等功能。小肠柱状上皮细胞的游离面有许多细小突起，称为微绒毛。微绒毛能增加细胞的表面积，有利于小肠吸收营养物质。
4、假复层纤毛柱状上皮：由柱状细胞、梭形细胞、锥形细胞和杯状细胞组成，其中柱状细胞最多。这种上皮的细胞高矮不等，在垂直切面上细胞核的位置也呈现高低不同，好象是复层，但每一个细胞的基部均位于基膜上，因而，实际是单层。其游离面有许多纤毛，纤毛比绒毛粗而长。纤毛能有节律地朝一个方向摆动，借助这种摆动，一些分泌物或附着在表面的灰尘、细菌等异物得以清除。这种上皮主要分布于呼吸道的腔面，具有保护和分泌功能。
5、复层扁平上皮：又称复层鳞状上皮，由十余层或数十层细胞组成。在上皮的垂直切面上，细胞形状不一。紧靠基膜的一层基底细胞为矮柱状，为具有增殖分化能力的干细胞，部分子细胞向浅层移动。基底层以上是数层多边形细胞，再上为几层梭形或扁平细胞。仅靠近表面几层细胞为扁平状，基底层细胞能不断分裂增生，以补充表层衰老或损伤脱落的细胞。复层扁平上皮深层的结缔组织内有丰富的毛细血管，有利于复层扁平上皮的营养。这种上皮分布于皮肤表面、口腔、食管、阴道等器官的腔面，具有耐摩擦和防止异物侵入等保护作用，受损伤后，上皮有很强的修复能力。
6、复层柱状上皮：有数层细胞组成，其深部为一层或几层多边形细胞，浅部为一层排列较整齐的矮柱状细胞。这种上皮主要分布于结膜、男性尿道和一些腺的大导管处。
7、变移上皮：又名移行上皮，是又一种复层上皮，衬贴在排尿管道的腔面。可分为表层细胞、中间细胞和基底细胞。其表层细胞大而厚，称盖细胞。一个盖细胞可覆盖几个中间层细胞。由于排尿管道的容积常有变化，上皮细胞的层数和形状也相应改变，从而使上皮的面积扩大和缩小。如膀胱空虚缩小时，上皮变厚，细胞层数较多，当膀胱充盈扩大时，上皮变薄，细胞层数减少，细胞形状也变扁。是专门行使分泌功能的上皮。以腺上皮为主要成份组成的器官称腺。腺上皮是在胚胎时期，由原始上皮形成上皮细胞索，向深层结缔组织内生长、分化而形成。
如果腺有导管与表面的上皮联系，腺的分泌物经导管排到身体表面或器官的管腔内，这种腺称为外分泌腺。又称有管腺，如汗腺、唾液腺、胃腺、胰腺等。
如果在发生过程中，上皮细胞索逐渐与表面的上皮脱离，不形成导管，腺细胞呈索、团或滤泡状排列，其间有丰富的血管和淋巴管。腺的分泌物（称激素）进入细胞周围的血管或淋巴管，随血液或淋巴液运送到全身。这种腺称为内分泌腺，又称无管腺，如甲状腺、肾上腺等。含有感觉细胞（初生的、次生的），具有刺激的感受机能。是由上皮细胞特化而成，如：嗅觉上皮、味觉上皮、视觉上皮和听觉上皮。脊椎动物的网膜和嗅上皮等都是这种上皮的代表例子。
