《宫锁沉香》大结局共有以下几点：
1. 徐仲九复兴太医院，成为了医学界的一代宗师。他也终于和身为女医生的锦觅走到了一起。
2. 苏哲在战乱中受伤，借着醉意提前向宫城外逃离，与世袭侯府的黄莺成婚，并一度失忆。之后，苏哲重新回归江山，守护自己的家族和国家。
3. 林姑娘与吕若梅因钟情徐仲九而结下不解之缘，两人在最后对话中，林姑娘表示她也是为了医学发展奋斗的，在这场比较之后，两人化解了矛盾。
4. 明玉被送回流放地，但在徐仲九和其他人的努力下突围成功回到京城，并嫁给了温柔贤惠的锦衣卫首领崔琮。
5. 最后，徐仲九因医治重病皇后，得到了名誉和重视，他与锦觅，苏哲和周家兄妹一起创设了医学基金，为民间普及医学知识和技术。
总的来说，《宫锁沉香》大结局是圆满的。故事中的每个角色都得到了自己想要的东西，同时也在这场波澜壮阔的乱世中得到了成长和升华。
