1. 尚不清楚持续使用电子烟是否有长期健康风险。电子烟大多数使用者时间不够长，且科学家需要更多时间和数据才能确定对健康的影响。
2. 化学成分不明确。因为电子烟是相对较新的产品，且未受到充分的监管，所以目前还不清楚其成分、燃烧产物中的离子和颗粒物大小的影响以及对人体的副作用。
3. 电子烟液体可能加入低劣成分或病毒。电子烟液体常被制造商称为“配方”，但并没有国家标准规定其必须包含什么以及不能包含什么，导致某些制造商可能会在其中加入低质量或不安全的成分。
4. 尽管一些电子烟宣传将其作为戒烟替代品，但实际上很少有证据支持这一说法。事实上，一些研究指出，使用电子烟的人实际上可能对尝试戒烟的电子烟（和其他替代品）成功率感到沮丧，并因无法戒除而反复吸烟。
5. 使用电子烟对非烟民的吸引。许多电子烟味道可口，芳香扑鼻，可能会吸引那些之前没有吸烟的人尝试；同时，一些电子烟厂商使用了类似于传统烟草广告的营销策略，这也可能导致不同年龄段或群体的人被吸引到开始吸电子烟。
6. 居民和工作者受到威胁。因为电子烟会释放出大量燃烧产物、二手烟和污染物；从而使家庭成员、同事和其他在使用电子烟或含电子烟的场所的人暴露在环境中，从而影响到他们的健康。
