运费谁出，主要取决于以下因素：
1. 协商结果：保税区到批发商的运费，在不同的双方协商结果可能会不同。因此，首先需要协商确定。
2. 货物性质：如果货物是由批发商自己选购，那么通常批发商会自己负担运费；但如果货物是由保税区内的企业直接向批发商销售的，则通常由保税区内的企业负责运费。
3. 数量和距离：如果货物数量较大、运输距离长，那么一般来说运费较高，可能需要由批发商和保税区企业共同承担。
4. 协议约定：如果双方有特别的协议约定，比如保税区内的企业可以为批发商提供免费运输服务，那么运费就由保税区内的企业承担。
总之，保税区到批发商的运费分配并没有固定的规定，需要在实际情况下进行具体协商。双方商定好后应签署合同，明确责任和义务，以避免后续产生纠纷。
