保税区和免税店是两种不同的概念和经济区域。它们的主要区别在于以下几个方面：
1. 定义：保税区指一个国家内设立的特殊经济区，通常具有较为灵活的税制政策和外贸政策，以吸引国内外企业或个人进入进行贸易、加工、仓储等活动；免税店则是专门提供受关税限制的商品，享受关税赦免和其他优惠政策的商店。
2. 功能：保税区的主要功能是促进国际贸易、加工制造、仓储物流等经济活动的发展，以及为企业提供投资环境和服务；免税店则是向消费者销售关税和其他税费比普通商店更低的商品，并且通常只针对境外游客开放。
3. 参与主体：保税区通常是政府为了吸引外商和支持本地企业发展而建立的特殊经济区域，参与者包括企业、投资者和政府等；免税店则是由商家或政府单独或联合成立的销售场所，主要服务对象是海外游客。
4. 位置和规模：保税区一般位于城市或港口周边，规模较大；免税店则一般在机场、边境口岸、海港等方便游客通行或聚集的地区设立，并且规模较小。
总的来说，保税区和免税店虽然在一些方面存在共同点，但是二者本质不同，所扮演的角色和发挥的作用也有区别。
