1. 了解批捕原因：职工被批捕是一件严重的事情，首先应该尽快了解批捕原因及相关情况，以便做出正确处理决策。
2. 查阅规定：各地对事业单位职工批捕后的处理有一定规定和程序，应当认真查阅相应规定和程序，了解应采取的措施和步骤。
3. 协助调查：如果职工的行为确实涉嫌违法犯罪，作为事业单位，应当积极配合警方和司法机关的调查工作，为打击犯罪保持高压态势尽一份力。
4. 维护工作秩序：即使职工被批捕，单位的工作仍需要继续进行。应当通过工作调整，确保工作不受影响，在维护社会稳定和单位正常运转方面发挥积极作用。
5. 保护职工权益：无论职工是否犯罪，其法定权益一定要得到保障。作为职工所在的单位，应当积极维护职工的合法权益，与相关部门共同做好职工家属的关心帮助工作。
6. 其他处理措施：针对具体情况，可根据实际需要采取其他处理措施，例如责令停职、调离岗位等。不过必须注意，这些措施都应当在法律规定的范围内进行。
