银耳根部的黄色部分是指其蒂部，一般情况下需要将其除去，具体原因如下：
1. 增加污染物：银耳蒂部经过长时间的运输和贮存过程中，可能会受到空气、水汽等污染物的侵染，如果不将其除去，会增加银耳本身的污染程度。
2. 增加口感的天然苦味：银耳的蒂部含有一定的味道成分，有时候可能存在微苦的味道。如果不将其除去，这些苦味可能会通过烹调和煮熟的过程中传递给食物，影响到银耳菜的口感。
3. 降低营养价值：银耳的蒂部含有的纤维素和其他成分较少，相比于银耳本身，其营养价值较低。因此如果不除去蒂部，会降低银耳菜的整体营养价值。
4. 安全问题：如果银耳的蒂部没有彻底清理，一旦孢子或者真菌在其中滋生，会对人体造成危害，导致食物中毒等不良反应。
综上所述，为了保证食品的安全卫生和提高银耳菜的口感和营养价值，我们建议将银耳蒂部完全除去。
