拖欠工程款是建筑行业常见问题之一，如果拖欠工程款已经超过诉讼时效，那么应该采取以下措施：
1. 了解法律规定：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，建筑工程劳务合同的诉讼时效期限为二年。如果拖欠工程款的时间超过了两年，就无法通过诉讼来追回欠款。
2. 尝试和解：即使已经超过诉讼时效，也可以尝试与欠款方协商达成和解，要求其还款。在协商的过程中，可以采取多种方式，例如提供还款分期，或者提供其他的资产作为担保等等。
3. 寻求法律支持：如何寻求法律支持的关键是找到证据证明有欠款。如果有证据证明欠款仍未得到支付，可以寻求法律支持。此时，法院可能会依据一些具体情况作出裁决，但最终裁决是否有效并不能保证。
4. 避免类似问题发生：对于工程款的收取，可以采取预付款，中期款和尾款的方式，从而避免类似问题再次发生。
总之，建议在合同签订时候就加入“拖欠工程款”的风险提示和严格具体的付款时间，在验收结算时的“不良工程”扣项合理，同时也要密切关注相关的法律法规政策。
