根据《长安十二时辰》小说和电视剧的情节分析，慕辞和裴护最后没有在一起。
1. 爱情线并不突出：虽然慕辞和裴护在一起时有默契、互动，但他们的爱情线却被其他复杂的情节所掩盖，故二者之间的感情发展并不十分明显。
2. 慕辞对药师帮仍有心思：慕辞作为药师帮的女首领，一直为了保护帮众而忙碌。在剧中，她的重心主要放在了维护药师帮稳定的工作上，而对于裴护的感情并没有特别明显的表现。
3. 结局没有揭示：电视剧结局中只显示了慕辞离开了长安城，但并没有清楚地告诉观众她何去何从。因此，无法确定慕辞和裴护是否会走到一起。
总之，慕辞和裴护之间的感情发展并没有很明显的描写和结局，因此不能确定他们最后是否在一起。
