“咦，他怎么会迟到呢？”这句话可以使用问号和顿号两种标点符号。
1.问号：问号用来表示疑问和询问的语气，表示说话者对某件事情感到不解、不理解或不确定。在这句话中，“咦，他怎么会迟到呢？”表示说话者惊讶和疑惑，询问是否出现了意外或特殊情况。
2.顿号：顿号用来分隔并列的词、短语或句子，表示这些成分之间有一定的关系，在语境中往往起到转折、进一步、强调等作用。在这句话中，“咦”和“他怎么会迟到呢？”是两个并列的成分，使用顿号将它们连接起来，同时起到强调“他怎么会迟到呢？”的作用，使整个句子更具表现力。
总之，对于这句话的标点符号应该是：“咦，他怎么会迟到呢？”（使用问号和顿号）
