一等座和二等座的座位布局和位置有差别，取决于具体车型和不同的运营需求。以下是具体分点回答：
1. 车型：一般情况下，动车组列车通常采用16节编组， 在2、3、5、6、8、9、11、12、14、15车厢设置一等座车厢，在1、4、7、10、13、16车厢设置普通二等座车厢。
2. 座位布局：动车组列车的座位布局有两种：靠窗和靠过道。一等座一般都有2+2的布局，座位之间有很宽的走道，且每个一等座都是可靠窗。而二等座则有更多种类型，分别是2+3、2+2、3+2等，并不是所有的二等座座位都是靠窗的。
3. 运营需求：动车组运营中，座位的布局和位置也要根据不同的客流量进行调整，根据实际需要设置特别的车厢，如商务座车厢、免费餐车等，这些车厢座位布局和位置不同与普通一、二等座车厢相比也有所不同。
综上所述，二等座的座位是否靠窗，需要根据具体车型和不同的运营需求进行调整。在选座时，建议提前查看列车的座位图进行选择。
