交警是可以查军车的。
2005年11月14日公安部印发的《交通警察道路执勤执法工作规范》的第九节——查处军车及特种车辆违法行为有规定如下：
第六十三条发现军队和武警部队的机动车有交通违法行为的，应当指挥机动车驾驶人立即停车，当场告知驾驶人违法行为基本事实，填写“军车交通违法、交通事故抄告记录单”，并要求驾驶人当场签名；当事人当场拒绝签名的，利用声像设备取证后，在“军（警）人交通违法行为通知书”上注明。
对正在执行紧急公务的军队和武警部队车辆，应当立即放行。第六十四条发现正在执行紧急任务的警车、消防车、救护车、工程抢险车等车辆有严重交通违法行为的，应当及时纠正，并记录车牌号抄告相关单位；非执行任务的，应当依法处罚。
第六十五条交通警察在纠正军队、武警部队驾驶人交通违法行为和特种车辆交通违法行为时，要做到事实清楚，严格按程序办事，快速处理，避免与驾驶人发生冲突，尽量减少群众围观。
但是，2009年1月1日起实施的《交通警察道路执勤执法工作规范》就没有上述有关规定了。原来的这个从2009年1月1日起就废止了。
拓展知识
交警（TrafficPolice），全称交通警察，属于警察的一个警种，主要负责在道路上执行指挥交通、维护交通秩序、纠正和处罚交通违章行为、处理交通事故、维护治安秩序等工作。
军车，在世界陆军作战中起到运送弹药、粮秣、伤病员，纵深突击以及保障防卫等突出作用的车辆。在世界各大战争和演习中，均担负长途机动，摩托化行军任务，是陆军必不可缺的行军工具。
《交通警察道路执勤执法工作规范》
