首先，2000多年前的兵家鼻祖孙武在《孙子兵法》开篇就提出“兵者，国之大也，生死之地，存亡之道，不可不察！”就是说，用兵作战是国家级别的大事，是国家生死存亡的关键，一定要小心从事。
其次，我国军队在南海引而不发有着深刻的政治和经济背景，并非仅仅处于军事战略考虑。
第三，单从战术层面考虑，
1、南海是一个南北狭长，东西宽度略窄的大陆架型海域。我国仅仅占据南海沿岸的最北部，而东南亚各国占据东、西、南三面沿岸地带。并在南海拥有大量作战力量（仅越南一家就在6个岛屿修建有机场，在超过11处岛屿修建有雷达站）如果我军兵力深入南海，很容易遭到沿岸各国的拦击；
2、同时由于南海南北长度超过2000千米，即使进行空中加油，我军战斗机抵达南海曾母暗沙也需要超过2小时，这么久的时间足够沿岸各国对我国舰队进行超过6次的空中打击！而且飞行员连续飞行2小时已经很疲劳，而敌人的空军以逸待劳，对我军不利。
3、说到最后，其实我国海军的军舰数量和质量目前都远远不足，整个南海舰队的驱逐舰、护卫舰就那么几艘，大家都清楚，用于岛屿补给的大型登陆舰，全海军不过18艘。如攻取南海，面对星罗棋布的超过一百个岛屿、沙洲、暗礁。我军分兵把守，在战略上就犯了力量分散的大忌，而后勤支援也非常遥远，相反越南、菲律宾、印尼等国则可以就近出击各个击破距离他们本国国土不到300千米的我军守岛部队。
4、短期作战行动对我们来说不是问题，我们集中兵力连续夺取南沙各岛屿都不难（毕竟岛屿都很小，最大的太平岛不过驻扎1个战术飞机中队而已），但是夺取以后防守却很困难，而且，军事补给长年累月，至少目前我国在南海开采的资源尚不足以抵消军事开支对国民经济的影响。
第四，从战略上分析，
1、东南亚各国本质上对于我国就深怀戒心，这个是有历史原因的，当年法国、荷兰、英国的殖民者为了控制东南亚，故意大量骗华人前往南洋“淘金”，然后给予一定的经济扶植，确保华人控制当地的经济系统，但是却把政治权力交给当地土著，有意挑起两族冲突。即使在东盟各国已经独立的今天，由于经济上对西方的依赖，东南亚各国依然在政治上非常靠近西方，而把我国作为对他们的威胁看待，从70年代越南的排华到98年印尼动乱，都是东南亚对我国不信任的直接表现。
2、美国为首的西方对东南亚各国的蛊惑和挑唆，同时有出口先进武器装备并提供所谓“军事合作”来诱导东盟国家对抗我国。而我国目前还处于经济上升期，我国综合国力目前还远远不及美国，所以不能给东南亚提供更多的军事、政治保护，而却在南海资源上和东盟形成天然分歧。
3、我国的经济模式，特别是东南沿海一带，和东南亚的经济模式非常类似，所以，我国实际上是东盟经济上最大的竞争对手，而东南亚和美国、西欧却是经济互补的关系，所以，东盟自然不希望看到一个强大的中国来抢占它的饭碗。
4、楼主你说的马六甲困局是个问题，但是并非唯一，因为我国由波斯湾到上海的石油航线不仅仅有大批我国的油轮，同样有挂各种“方便旗”的其他国家商船，即使开战东盟禁止挂中国国旗的油轮通过，但是依然有大批挂第三国国旗的油轮可以进入我国港口，油路不会受太大影响，但是肯定会有一定幅度的升高。
5、我国目前没有解决南海问题内在核心在于台湾问题和中日东海问题也牵扯了很多精力，这两个战略方向如果得到一定缓解，我们集中兵力于南海，局面也绝不会是今天这个样子。但是，无论日本、台湾都不是省油的灯，都有一支强大的舰队（不要小看台湾，战术上，台湾海军还是很有实力的），不搞定他们，我们解决南海问题，他们肯定会背后捅刀子。
总之，南海是一个困局，这个局部要放在我国整个海防危机的大环境里去考虑，朝鲜－东海－台湾－南海是一个连环套一样的困局。目前我们在一方面加强自身海军建设的同时，一直在寻找一个真正突破口，可以一举突破这一困局。
