1、定义不同
工厂又称制造厂，是一类用以生产货物的大型工业建筑物。大部分工厂都拥有以大型机器或设备构成的生产线。在世界近代史中泛指资本主义机器大生产，即使用机械化劳动代替手工劳动的资本主义工业场所。
有限责任公司，简称有限公司，中国的有限责任公司是指根据《中华人民共和国公司登记管理条例》规定登记注册，由五十个以下的股东出资设立，每个股东以其所认缴的出资额为限对公司承担有限责任，公司法人以其全部资产对公司债务承担全部责任的经济组织。
2、性质不同
工厂代表有生产能力，公司不一定，如贸易公司也是公司，但不是工厂，因为它没有生产能力，另外有个共同的地方，均由法人代表注册，通过国家认证的，但是成立依据的法律法规不同，公司是依照国家《公司法》的规定成立的。
工厂则显然不是这样，但也是企业组织模式之一，现实生活中，有向公司逐渐靠拢的趋势，公司制的工厂越来越多。公司是具有法人的机构或企业。工厂只是一个实体，没有法律上的意义。
3、主体表达不同
工厂是一个通俗的称谓，即表示该主体是一个以加工或生产为主要业务内容，但按照现代企业的名称来定义，可以用有限公司来称谓，比如现在的工厂在工商局登记注册时，一般都注册为有限公司或公司。
而有限公司的意思是该企业日后发生破产，清算时将以注册资本为限，即超过注册资本的部分不再赔偿。且有限公司可以是生产企业，也可以是贸易或其它企业，比如有些商业银行也是有限公司。
