1949年，国民党内战失利，蒋中正（蒋介石）率部分国民党军政人员退踞台湾，5月19日颁布《台湾省警备总司令部布告戒字第壹号》（简称台湾省戒严令），宣布台湾处于战时动员状况，封闭全省，限制出入境，实行军事管制，封锁大陆消息，严禁一切违禁的言论、出版和罢工、游行等活动。12月7日，“中华民国中央政府”迁至台北市。12月11日，国民党中央党部迁至台北市。至此台湾再次陷入与中国大陆的分离状态之中。
国民党迁台后进行大规模党务改造运动，建立起蒋氏父子对国民党的绝对控制权，经济上进行财政整顿，改革币制，稳定物价，实行土地制度改革，恢复与发展农业生产。
国民党在戒严体制下巩固与强化专制统治。1960年蒋中正通过“国民大会”修订《动员戡乱时期临时条款》获得连任而成为“终身总统”。同时国民党最高权力开始向蒋经国过渡。在白色恐怖统治下蒋氏父子对党政军严格控制，对反对势力采取严厉打击的高压政策。
由于得到美日等外国资本的支持，实施利于经济发展的政策，日据时期的基础，美国提供数十亿美元经济军事援助和运用从大陆运去的黄金、美钞等外汇以及从大陆赴台的人才，台湾经济从1960年代开始进入快速发展时期。1960、70年代台湾形成出口导向型经济发展模式，工业占经济中的比重逐渐超过农业，长期保持年均两位数的经济增长率。
1979年，全国人大常委会发表《告台湾同胞书》，宣布了和平统一祖国的方针，同时大陆停止炮击金门，实现两岸的真正停火。
1979年台湾与香港、韩国、新加坡被经合组织列入新兴工业化社会，被称为“亚洲四小龙”，台湾经济奇迹威名远扬。1980年代台湾工业基础完备，国民教育普及，人均GDP超过6000美元，股市指数一度高达万点，高新技术产业蓬勃发展，个人电脑主板产量世界第
1993年4月汪辜会谈前汪道涵与辜振甫握手。
1986年党外人士成立民主进步党。1987年7月15日，蒋经国发布“总统令”，宣布解除实行长达38年的戒严体制，随后更进一步开放党禁及报禁、各级权力机构的全民普选、民众赴大陆探亲及与大陆经济、文化等方面的交流。台湾开始朝向民主政治发展，海峡两岸长期隔绝的状态也被打破。《动员戡乱时期临时条款》于1991年废除。
1990年台湾成立办理海峡两岸交流所衍生的各项事务的民间组织海峡交流基金会，1991年大陆成立海峡两岸关系协会。1992年海协会和海基会达成海峡两岸均坚持一个中国原则的重要共识（“九二共识”）。1993年海协会会长汪道涵和海基会会长辜振甫举行会谈。1996年台湾举行首次领导人直选，国民党参选人李登辉当选。1999年9月21日南投县集集镇发生里氏7.3级地震，为台湾战后伤亡损失最大的天灾。
2000年在台湾地区领导人选举中，执政50余年的中国国民党败选，民主进步党执政，陈水扁当选。2001年福建沿海实现与金门、马祖地区直接往来（“小三通”）。
2002年以“台湾、澎湖、金门及马祖个别关税领域”名义加入世界贸易组织。2004年陈水扁获得连任。2008年马英九当选台湾地区领导人，中国国民党再度执政；同年海峡两岸实现直接通邮、通航、通商（“大三通”）。2009年8月莫拉克台风侵袭台湾造成严重水灾，中南部与东部蒙受巨大损失。2010年6月29日海峡两岸签署《海峡两岸经济合作架构协议》。2012年马英九获得连任。
