草莓枯萎病主要为害根部，由于根部受害，病株黄矮，重者枯死，主要发生在高温期，多在苗期或开花至收获期发病。主要通过病株和病土传播，连作或土质黏重、地势低洼、排水不良都会使病害加重。
草莓枯萎病防治以防为主，综合防治。
1）选用抗病品种，建立无病苗圃，从无病田分苗，栽植无病苗。
2）避免重茬。采用一年一栽制，与其它农作物实行合理的轮换倒茬栽植。前茬不能是茄科等有共同病害的作物，最好进行水旱轮作，与禾本科作物进行3年以上轮作。并且施用充分腐熟的有机肥。
3）进行土壤消毒可以减轻病害的发生。在7～8月全年太阳辐射能量最大，气温最高的时期进行太阳能消毒处理。每亩增施2000公斤有机肥，70公斤石灰氮，撒匀后翻入土中，然后南北起垄，垄宽60～70cm，高30cm，灌透水并保持垄沟中有较多积水后，再用白色旧地膜覆盖，密闭大棚一个月，利用高温杀死大部分病
原菌。
4）化学药剂防治。用20％甲基托布津300倍液浸苗5分钟后再定植；发现病株及时拔除，集中烧毁，病穴用生石灰消毒；发病初期用多菌灵、福星、百菌清、波•锰锌、代森锰锌、扑海因、世高等药剂喷淋茎基部，隔10天左右1次，共喷5～6次，或用上述药液灌根。
