自20世纪90年代末起，中国在深海勘查方面获得了一批创新性成果。这些成果具体体现在5个方面：
第一，深海生物资源探测与保藏取得显著成效，彻底改变了我国在国际海底基因资源研发领域的状况。获得大量深海微生物资源，分离了近1万株微生物，建立了第一个深海菌种库，目前库藏海洋微生物2.2万株，涵盖3400多个种，国际领先；构建了第一个深海微生物宏基因组大片段基因库，完成了近300株海洋微生物的基因组测序；构建了国内第一个深海微生物代谢物库与信息库，库藏馏份达1.5万份。
第二，系统开展资源应用潜力评估，获得一批深海知识产权，在医药、环保、工业、农业等领域展现了良好的应用前景。完成了4000多株微生物资源在海洋药物、生物农药、环境保护、生物技术、工业酶应用等方面的潜力评估，申请国际国内发明专利200多项；建立有海洋微生物中试平台；多项研究成果已经完成应用示范，部分实现了产业化应用。
第三，深海生物基础研究硕果累累。发表SCI论文500多篇；完成100多个海洋微生物新物种分类与系统进化研究，使我国成为国际上深海微生物新物种发现与分类的重要力量；在深海微生物功能与代谢机制研究方面取得重要进展，其“海洋石油降解菌研究”成果入选“2014年中国海洋十大科技进展”。
第四，大洋生物勘探技术显著提高，形成了“三龙”深海探测，微生物海底长期原位培养等系列创新性深海装备。目前，我国海洋调查船队已增加至近40艘，逐步形成了以“蛟龙”“海龙”“潜龙”为代表的“三龙”深海装备体系。特别是载人潜水器蛟龙号的应用，显著提高了精确获取生物样品的可能性和准确性。此外，还形成了完善的深海生物实验室研究平台，为我国海洋生物科学研究提供有力支撑。
第五，积极参与国际合作，国际影响力日益提升。推进与法国、日本、美国、德国等国家在大洋生物资源探测方面的合作交流，我国科研人员在某些领域逐渐发挥主导作用。由大洋协会支持发起的国际深海微生物研讨会，目前已在中国、法国、日本、韩国等国家举行了6届。中国海洋微生物菌种保藏管理中心已加入世界微生物联盟，充分展示了我国在海洋微生物资源管理方面的贡献。
