2004年初
百度化学吧创建。
2008年6月28日
由于2008年奥运会即将到来，所以百度对可能造成安全隐患的所有贴吧、帖子实施清理。由于采访事件引发的魔神实验室等化学吧旗下四大实验室被封，百度将化学吧封锁，史称“08年封吧事件”。之后在吧友的要求下，百度将化学吧的封禁改为“审核发帖”。
2009年11月19日
百度化学吧解封
2010年5月16日
某吧主ID被血色圣光所盗，所有小吧主被解职，大量会员失去会员资格，图片和视频被清空，损失惨重，当日中午开始恢复秩序。但是盗号者把会员名称改为“血你妹”并持续至月底。史称“血你妹事件”。这里的血可以理解为是名词做动词，使动用法，为“让……出血”。
2011年8月末
第一次“化学吧民主运动”，由吧务删贴引起的不满被某些吧友着重提出，以“民主”为象征性目标和口号开始的全吧性大混乱。牵扯到吧内新老吧友的矛盾和水贴问题。最终，时任吧务辞职，事件缓和。而当时的问题并没有解决。自此，化学吧维持数年的平稳状态被打破，矛盾激化，平均每半年出现一次混乱。化学吧是百度学术贴吧中由于吧友和吧务矛盾造成混乱最多最严重的贴吧，此情况至今没有改变。
2012年2月11日
全体吧务解散，化吧陷入空前动乱，即所谓的“211事件”。当时爆吧贴水贴广告贴能才贴横行，吧规禁止的所有东西当时满贴吧都是。 2012年6月26日
百度化学吧第一次百度官方授权的活动开始：晶体制作大赛。同时也小规模引起了百度贴吧的晶体制作热潮。
2012年7月28日 起因是五天前爆照贴泛滥了一次，然后某爆照贴被吐槽后直接导致小规模混乱，继而升级到大规模水贴爆发，于是第一次限水开始。但这次并没能长久。
2013年2月11日
化学吧吧务大放假事件，所有吧务集体放假三天。这件事最初的原因是部分吧友对新吧规意见很大，对吧务正常的操作行为有很大的抵触情绪。而且部分老吧友也借机闹事。因此卡曼奇和活动星图提出用放假这一形式，暂停对化学吧的管理，使化学吧部分对吧务有抵触情绪的吧友转变对吧务存在必要性的想法。事情结束以后，吧友对吧务的意见不见减少，反而变得更大，甚至有部分吧友密谋推翻现任吧务，然后因为各种原因没有得逞。
2013年3月1日
时任小吧主活动星图进行了一次禁水实验，时长15天。内容大致是回帖必须15字以上，且不准发纯表情帖，禁止一切水贴等。但因为规定太过严苛，导致反对的呼声过高，最后失败
2013年7月19日
百度化学吧第一届化学竞赛开始，时间为7月19日18:30至22:30
2013年8月13日
1个月的试行禁水后，经吧友投票与化学吧吧务组决定，化学吧长期禁水，在学术性贴吧的发展道路上迈出了坚实的一步。
2014年1月30日
小吧主inlook121联合数学吧、物理吧、生物吧与云里明阳吧举办了2014第二次假面舞会，上一次假面舞会在2010年在江上清风吧举办。
2014年初
某吧友发帖为铝热反应正名，受到许多吧友以及吧务的反对。后因此掀起围攻家庭实验党事件，导致大量吧友退吧抗议。后在吧务组的努力下，才平息此事。
2014年3月22日
世界水日，吧务决定放水一天，当日产生的水贴将于晚12点删除。
2014年7月28日
时任大吧主真·凤舞九天辞职，理由据说是要去考研（这是大部分吧友的观点，不代表真实情况）
2015年3月22日
吧务首次正式开帖声明对非化学的有质量的帖子的鼓励。
初次开放的非化学帖白名单有：音乐鉴赏和新闻播报（非娱乐新闻）。
