社保基数是根据员工上一年度月平均收入确定的；
而个人所得税缴纳基数是按照员工当月的应发工资（除去社保和公积金）-3500（免税额）计算的。
一、工资为5500元每月，帮你分析一下，需要交纳的保费的计算如下所示：
1、医疗保险：个人承担2%，单位承担8%； 5500*2%=110元，单位5500*8%=440元；
2、养老保险：个人为8%，单位承担12%； 5500*8%=440元，单位5500*12%=660元；
3、失业保险：个人为1%，单位承担2%； 5500*1%=55元，单位5500*2%=110元；
4、工伤保险:个人无，单位1%； 个人无，单位5500*1%=55元
5、生育保险:个人无，单位1%； 个人无，单位5500*1%=55元
6、公积金：个人3.5%,单位3.5%；5500*3.5%=193元，5500*3.5%=193元。而工伤和生育保险的费用均由单位承担。
因此个人总计为：802元，单位总计为：1650元。
计算的数据可能会与实际的有出入，但计算的方式是这样的.
因此需要交纳的税率基数为5500-802=4698元，而个人所得税计算方法：（收入额-2000元）*适用税率-速算扣除数 即
（4698-2000）*15%-125=279元
因此剩下的余额为：6000-802-279=4919元左右。
除去税收和保险，应该代发工资为：4919元左右。
二、按国家规定，社保如果你是刚入公司那就以第一个月的工资为基数。如果你是入公司多年，按你上一年的平均工资为基数。
工资减去社保（公积金）之后再算个税。
三、公积金与社保是一样的。基数乘以百分之几（这要看你们当地的比例，全国每个地方和每个地方不一样，北京的12%）
扩展资料：
1、社会保险基数简称社保基数，是指职工在一个社保年度的社会保险缴费基数。它是按照职工上一年度1月至12月的所有工资性收入所得的月平均额来进行确定。
社会保险缴费基数是计算用人单位及其职工缴纳社保费和职工社会保险待遇的重要依据，有上限和下限之分，具体数额根据各地区实际情况而定。
2、个人所得税（personal income tax）是调整征税机关与自然人（居民、非居民人）之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。
英国是开征个人所得税最早的国家，1799年英国开始试行差别税率征收个人所得税，到了1874年才成为英国一个固定的税种。
个人所得税的纳税义务人，既包括居民纳税义务人，也包括非居民纳税义务人。居民纳税义务人负有完全纳税的义务，必须就其来源于中国境内、境外的全部所得缴纳个人所得税；而非居民纳税义务人仅就其来源于中国境内的所得，缴纳个人所得税。
个人所得税是国家对本国公民、居住在本国境内的个人的所得和境外个人来源于本国的所得征收的一种所得税。在有些国家，个人所得税是主体税种，在财政收入中占较大比重，对经济亦有较大影响。
2018年6月19日，个人所得税法修正案草案提请十三届全国人大常委会第三次会议审议，这是个税法自1980年出台以来第七次大修。 全国人大常委会关于修改个人所得税法的决定草案2018年8月27日提请十三届全国人大常委会第五次会议审议。依据决定草案，基本减除费用标准拟确定为每年6万元，即每月5000元，3%到45%的新税率级距不变。
2018年8月31日，修改个人所得税法的决定通过，起征点每月5000元，2018年10月1日起实施最新起征点和税率。
参考资料： 社会保险基数-百度百科 个人所得税-百度百科
