这么做肯定是不合法的。但是现在的社会，不合法的事情多着了，新的劳动合同法已经实施一年了，可是真正能照章办事的单位又有几个？
你要是想辞职的话，提前30天以书面的形式正式通知用人单位就可以了，最好有用人单位看到你的辞职通知的证据，比如领导签字什么的。这样就可以了，至于你要交的违约金、培训费都不用你交（如果公司出钱让你出去参加培训什么的，然后你获得了什么证书什么的，那部分可能你得交，但怎么也不至于50w吧！），你这样辞职是合法的。当然可以要回你的毕业证和学位证了，他们无权扣押你的任何东西的。只要属于你的私人财产，他们就无权占有。
