自然人股东：相对于法人股东，是具有公民身份的个人投资者。在他对公司进行投资后，通过公司所在地的工商局登记公司股份，并登记公司股份，成为自然人股东。自然人是基于自然出生而依法在民事上享有权利和承担义务的个人。百度百科
非自然人股东：是参与公司投资的企业法人。
两者的区别：在于一个是具有公民身份的个人；一个是企业法人。
自然人和非自然人的具体区别：《民法通则》第三十六条规定，法人是具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务的组织。第三十八条规定，依照法律或者法人组织章程规定，代表法人行使职权的负责人，是法人的法定代表人。法人是一种虚拟的实体，而代表法人组织行使权力的人才是平常的自然人。
拓展内容：
法人股东：法人股东亦称单位股东，是指以公司或集团(机构)名义占有其他企业股份的股东。公司股东中数量最多的一类是企业法人。一般依法设立的各类企业法人均有权对公司投资，成为公司的股东，而没有专门的限制。《中华人民共和国公司法》第15条规定：“公司可以向其他企业投资；但是，除法律另有规定外，不得成为对所投资企业的债务连带责任的出资人。”企业法人对公司出资成为公司股东的前提是具有民事权利能力。该企业法人必须依法存续，即企业法人应当具备《民法通则》规定的条件，未依法办理核准登记手续，不存在被撤销、解散、宣告破产或其它终止企业法人的情况。法人股东
考资资料：百科、中华人民共和国《民法通则》。
