农村环境综合整治主要包括以下内容：
一是加强宣传教育，提高农民环保意识。充分利用宣传教育阵地，运用各类媒体大力宣传治理农村环境污染的必要性和紧迫性，积极引导广大农民摒弃陈规陋习，培养他们健康文明的生产、生活方式，强化他们的环保意识。
二是完善监管体系，强化落实目标责任。环保部门应不断深入农村，检查督促环保法规的落实情况以及环境监测、监察情况，加强农村环境保护的执法监督，建立环境报告制度，促进有关部门真正把环境管理和生产管理有机结合；在乡、村、组三级建立乡(镇)长、村主任、组长负责的农村环保责任机制，细化任务，加强检查，确保责任落实;建立激励与约束机制，严格落实问责制，促使农村生态环境保护走上常态化、规范化、制度化轨道。
三是加大综合治理，全面开展环境整治。重点抓好水污染治理、饮用水源保护、固体废弃物治理、人畜粪便污染治理和综合利用，对污染和破坏农村环境的违法行为依法查处。全面落实农村环保“以奖促治”政策措施，率先针对重点流域、区域和问题突出地区开展集中整治，着力解决危害农民群众身体健康、影响农业农村可持续发展的突出环境问题。如：清理积存垃圾和其他有碍观瞻的杂物以及污水，重点治理农村乱堆乱放、乱搭乱建、乱倒乱流、乱种乱养、乱贴乱画等“十乱”现象。
四是设立环治基金，建立环保长效机制。加大对污染防治、生态保护的资金投入，并建议设立专项基金，重点解决所辖地区污水和生活垃圾的处理。有条件的乡镇应该征收垃圾处理费，设专(兼)职乡村环卫人员，担负一定范围的保洁和环境卫生监督职责。同时，成立专门的农村基层环保管理机构，建立农村环境保护长效机制，从源头上处理好农村生活垃圾和生活污水，保护饮用水水源。要积极探索农村保洁有偿收费制度，采取政府投、乡镇帮、村级为主的方式，确保农村环卫整治和保洁工作有经费保障
