1.两个概念。代扣代缴是发放工资的单位的义务。12万是个人的申报义务，两者是分开的，并不冲突和矛盾。
2.实际上，这并不影响日常每月按工资薪金所得计算缴纳个人所得税，年度的申报只是对全年12个月工资薪金所得和缴纳个人所得税数据的一种汇总申报。若日常按月都足额缴纳了个人所得税，年度汇总申报时基本上不存在补税情况。
3.年入12万自行申报让我们有一种重复交税的感受。但现实，年入12万自行申报这个规定，本来即是向税务机关做一个“汇总”，让税务机关知道你现已准时按月交纳了个税。当然，年入12万自己申报也具备查遗补漏的效果，假定你少缴了，那你就要补缴；假如你多缴了，那你也能够退税、抵税。这样，不仅减少了交税人逃税的危险，也避免了交税人多缴税的丢失。
扩展资料
个人所得税法是调整征税机关与自然人（居民、非居民人）之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。个人所得税法，就是有关个人的所得税的法律规定。在我国，个人年度收入超过一定的限额时，必须进行个税申报。
年所得12万元以上，是指一个纳税年度内11项所得合计达到12万元。这11项包括：“工资、薪金所得”、“个体工商户的生产、经营所得”、“对企事业单位的承包经营、承租经营所得”、“劳务报酬所得”、“稿酬所得”、“特许权使用费所得”、“利息、股息、红利所得”、“财产租赁所得”、“财产转让所得”、“偶然所得”以及“经国务院财政部门确定征税的其他所得”。
如果个人在一个纳税年度内取得所得超过12万元，无论其平常取得各项所得时是否已足额缴纳了个人所得税，或者是否已向税务机关进行了自行纳税申报，年度终了后，均应当按《办法》的有关规定向主管税务机关办理纳税申报。
另：年所得12万元以上，不包括在中国境内无住所，且在一个纳税年度中在中国境内居住不满1年的个人。
（参考资料 百度百科 个税申报）
