食品药品监督管理局日常工作主要是草拟文件、转发市局文件、组织质监、工商、卫生等部门开展各季度食品抽验（具体工作因地方不同而有所不同）、编写食品安全信息、保健食品广告检测等。
目前食品药品监督管理局食品科主要工作是：负责对食品安全的综合监督、组织协调和依法组织查处重大事故。
另外，政府的食品药品安全委员会办公室也设在药监局，区食品药品安全委员会主要职能是：贯彻落实国家和省、市、区有关食品药品安全的方针、政策；协调实施全区食品药品放心工程；定期分析全区食品药品安全形势；协调食品药品联合“打假”行动；协调处理食品药品安全重大事故；定期听取各食品药品安全监管部门工作情况汇报；督导各部门食品药品安全责任落实情况。
目前正在进行机构改革，改革以后，食品药品监督管理局将负责餐饮业和食堂等消费环节的监管。
