2000年，教育部批准武汉大学信息资源研究中心为国家人文社会科学重点研究基地，也是该领域唯一一所重点研究基地。2001年信息产业部批准成立国家信息资源管理（武汉）研究基地。2006年新闻出版总署批准建立出版发行学高级人才培训（武汉）基地。2003~2005年网络信息资源开发与数字图书馆建设被国家计委、教育部等批准为十·五211重点学科建设项目，总投资为560万元，2006年顺利通过建设验收。2004年建立一级学科博士后流动站。2004~2007年，武汉大学信息资源研究创新基地被列为国家985二期工程建设项目，总投资3600万元。一批院内校级重点研究基地如武汉大学四库学研究所、武汉大学科学评价研究中心、武汉大学电子文件与政府信息化研究中心、武汉大学知识产权高级研究中心、武汉大学数字图书馆研究所、武汉大学出版科学研究所、与中国电子商务协会联合建立武汉大学中国电子商务研究与发展中心、经联合国教科文组织(UNESCO)授权成立的联合国教科文组织信息软件推广培训中心等研究开发机构也在本科人才培养中发挥着重要作用。
