我想，您所说的Linux系统指的是Linux发行版吧。
Linux发行版有很多，比如，redhat，ubuntu，arch，centos等等。
首先，你已经知道安卓是基于Linux内核开发的了，那么你就是明白安卓的内核是Linux，而不同的是应用框架，这部分也就是你最直观的感觉到不同的地方。
Linux发行版有一系列GNU的开源程序和库，而安卓则是专门为手机定制了库，而应用程序，基本上是不开源的。
因此，如果你只是想使用Linux内核的系统，那么安卓就是，只是修改了一些；
如果你想要使用Linux发行版的，那么你就需要刷机了，而且刷机的过程中，可能会有驱动程序不能使用的问题，因为安卓系统是手机厂家专门定制开发的驱动，如果你冒然刷Linux发行版，很大的可能是驱动问题解决不了。
