日本地处以温带和亚热带季风气候为主，气候温和、四季分明，具有海洋性典型特征。全国横跨纬度达25°，南北气温差异十分显着。
北海道与本州东北地区、高原地带属温带，本土大部地区及冲绳等南方诸岛则为亚热带。此外，日本所处位置令她受到季候风及洋流交汇的影响，因此四季分明、降水充沛。
是世界上降水量较多的地区。主要原因包括了日本海侧地区冬季的降雪；6、7月（冲绳、奄美为5、6月）间连绵不断的梅雨；以及夏季到秋季登陆或接近日本的台风。日本有记载的最高温度纪录是40.9度，于2007年8月16日在崎玉县熊谷市和岐阜县多治见市测得；有记载的最低温度纪录是-41度，于1902年1月25日在北海道旭川市测得。
