NK细胞对靶细胞的杀伤作用有四个途径：
穿孔素/颗粒酶途径；
Fas/FasL途径；
TNF-α/TNFR-I途径；
ADCC效应：NK细胞表面的Fc受体能够和与病原体结合的IgG的Fc段结合，从而杀伤靶细胞。
这些都和细胞毒性T细胞类似。
巨噬细胞在固有免疫中，对病原体的清除作用主要有五个途径：
氧依赖途径：通过反应性氧中间物（活性氧）和反应性氮中间物（一氧化氮）进行杀伤和清除；
非氧依赖途径：制造酸性环境、释放溶菌酶等非氧依赖途径导致病原体裂解；
消化和清除：多种水解酶，如蛋白酶、核酸酶等对病原体进行消化降解；
直接杀伤靶细胞：可通过分泌细胞因子或者表达相应的受体（PRR等）和靶细胞结合进行清除
巨噬细胞表面的Fc受体能够和与病原体结合的IgG的Fc段结合，从而杀伤靶细胞
综上NK细胞和巨噬细胞都能够通过细胞因子途径（如TNF-α）和ADCC效应杀伤靶细胞，但NK细胞特有穿孔素/颗粒酶途径以及Fas/FasL途径，这两者能够更为高效地杀伤靶细胞。而巨噬细胞则可以创造一个良好的免疫反应微环境，促进炎性反应的进行。
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