1、派遣证的作用在于计算工龄和确认干部身份。工龄的话，如果没有派遣证，也可以通过第一份工作合同或第一份有单位负担的社保的时间开始计算，这个好说。干部身份的话，若没有派遣证是没有的。如果你一辈子只在社会上的公司工作，那干部身份用处不大，可能退休时会比有干部身份的人养老金要略少而已。但是如果你去机关、事业单位工作，没有干部身份会受很大的影响。这些单位基本不会录用没有干部身份的人。即便你去这些单位上班，要么是不在编的临时工、派遣工，要么只能走工勤编。你在这些单位升职、待遇、退休都会被区别对待。
2、是否能算应届，我个人认为应该算。这和你档案在哪没什么关系，只要你上的是全日制统招，就应该算。这个我建议你咨询一下学校的教务处。另外你可以再和单位商量一下，可否保留岗位，档案先调走，毕业后再调回来，当然这个不大可能
