巴西龟每年都有冬眠的习惯，一般从每年的9、10月份开始，它就需要为自己的冬眠做准备。当环境温度低于15摄氏度时，巴西龟会开始进入冬眠。当环境低于5摄氏度时，就彻底进入冬眠。东面时期的巴西龟一动不动，而且只要保证环境温度在4摄氏度以上，巴西龟就能顺利、安全的度过冬眠。
巴西龟的冬眠季节一般从每年的11月开始一直持续到来年的3月份。冬眠时期的巴西龟会完全停止进食，它们会一直睡觉直到冬眠结束。巴西龟的抗寒性还可以，大多数情况下，它们都能顺利安全的度过冬眠期，然后随着气温的回升，开始慢慢的苏醒，开始一年的新生活。
在巴西龟冬眠的时候饲养者应该注意。不要随意的去吵醒巴西龟，为了保证巴西龟顺利冬眠，家长可以将鱼缸搬到室内，偶尔放在阳光照射的地方，晒1-2小时太阳，达到杀菌的目的，又可以促进巴西龟身体钙质的吸收。
同时，巴西龟在冬眠的时候也不能离开水，因为离开水巴西龟就会生病，甚至是死亡。饲养者应将巴西龟放在有水的缸中过冬，而准备的水不要太多，水放到龟背即可。而且，还可在缸里面放一块方形砖或石块，以保证巴西龟能顺利的冬眠。
