有些细菌(如大肠杆菌)能靠鞭毛的摆动进行移动,但是它们并不是动物,因为它们都是原核生物,细胞内没有细胞核,只有一个裸露的环状DNA分子,而动物一般都是真核生物,即有膜包被着DNA,且DNA一般与组蛋白缠绕成一体,形成染色质或染色体;生殖方式主要是裂殖即一分为二的方式,这与动物的有性繁殖有很大区别。当然这里只是谈了细菌和动物的两点区别,而不一定是区分二者的标准。
有些教科书上,把草履虫归结为微生物,有些动物学书上也把它拉入自己的阵营。我倾向于把它归属于动物。
综上所述,之所以会产生这么大的分歧,其原因是目前没有任何一个定义可以准确的概括动物、微生物(包括细菌)的主要特征。